查慎行好游山水，喜蓄典籍，73岁时退居里中，贮书万卷，坐卧其中。卒之日，惟手勘万卷书。家有“得树楼”，藏书甚富。管庭芬《拜经楼藏书题跋记·跋》称其“国初吾邑东 南藏书家，首推道古楼马氏，得树楼查氏，盖两家插架多宋刻元抄，而于甲乙两部积有异本，其珍守已逾数世，不仅为充栋计也”。查氏兄弟均有藏书之好，查慎行家有“得树楼”，藏书甚富；次查嗣僳，筑“查浦书屋”藏书；季查嗣庭（1664～1727）字润木，有“双遂堂”藏书。后查嗣庭以文字狱戮尸，亲族子弟，均受株连，慎行以年老放归，三弟则遗留关西，藏书散失无存。所藏书钤有“查氏初白”、“南书房史官”、“希古”、“得树楼藏书”、“海宁查慎行字夏重又字悔余”、“初白庵主人”等印。至乾隆时，孙查岐昌仍以得树楼命藏书之所。藏书散佚后，吴骞曾得其残帙数种。著有《得树楼杂抄》、《经史正伪》、《随猎日记》、《周易玩辞集解》、《苏诗补注》、《黔中风土记》、《人海记》、《敬业堂诗集》等。